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100多名古人类基因组,揭示数千年乙肝感染史

Nature自然科研 2018-05-10 11:02:11 阅读:

本周,丹麦哥本哈根大学的Eske Willerslev及同事在《自然》期刊上发表了两篇论文137 ancient human genomes from across the Eurasian steppes和Ancient hepatitis B viruses from the Bronze Age to the Medieval period,其中一篇报道了137名约生活在1,500-4,500年前的古人类的基因组序列,另一篇分析了这137人的基因组和另外167名青铜时代人类的基因组,并在其中25人体内发现了乙型肝炎病毒(HBV)的证据。以上发现表明欧亚人类感染HBV的历史已有数千年之久。

100多名古人类基因组,揭示数千年乙肝感染史

古代样本的文化和地理呈现。

Damgaard et al.

作者测序了来自欧亚大草原的137名古人类的基因组,覆盖了长约4000年的一段时期(欧亚大草原是西起匈牙利,东至中国东北的一片长约8000公里的广阔区域)。此外,他们还研究了自我报告为拥有当今中亚、阿尔泰、西伯利亚和高加索血统的502名个体的基因组数据。这些发现帮助阐明了该区域的种群历史,表明青铜时代欧亚血统的牧民逐渐过渡至主要为东亚血统的骑兵。

在第二篇论文中,Willerslev及其共同作者分析了304名来自欧亚中部及西部的古人类的DNA序列,这些人约生活在200-7,000年前。作者在25个人的体内发现了HBV感染证据,时间跨度近4000年。他们恢复了12个完整或部分的HBV基因组——包括目前已经灭绝的基因型,并把它们和当代人类及非人类灵长类动物的HBV基因组放在一起加以分析。结果发现某些古代HBV基因组的所在区域与其现今的分布区域不一致,而且至少有一种基因型现已灭绝。

100多名古人类基因组,揭示数千年乙肝感染史

样本和现代基因型的地理分布。

Mühlemann et al.

全球约有2.57亿人口长期感染HBV,2015年约有88.7万人死于相关并发症,但是该病毒的起源和演化一直不甚清楚。发现更古老的病毒序列或可以更加清楚地揭示HBV的真正起源和早期历史,并且帮助理解自然及文化变化对疾病负担与死亡率的影响。

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